花蓮港商漁船共用航道所衍生問題，在「花蓮專用漁港」興建後，可能因商漁船交通量快速增加，加上過窄的內港航道，使得商船進出港時，漁船管制不易執行，兩者在內港航道上相互衝突的情況將更形嚴重。本研究希望對商漁在航道航行時相互干擾現象有所改善。