從土壤微生物生態、水庫微生物生態、絕對厭氧性微生物分離及應用，微生物生態與植物保護、相剋物質、污水處理、有毒物質分解、除氮去磷和材料腐蝕之關係，溶磷、固氮及多功能微生物肥料之開發，微生物在食品加工上之應用，利用分子技術探討微生物在環境中之傳輸及組成，細菌蛋白質之分泌，基因轉殖作物、微生物資源在食品產業安全性評估等