為能掌握寶二水庫完工後水庫營運管理及新竹地區水資源調配工作，寶山第二水庫營運管理系統規劃、設計及建置計畫主要以頭前溪水文測報及逕流預報系統、水庫放流警報系統、水源調配管理系統管理之規劃建置工作為主，並檢討及規劃燥樹排攔河堰、隆恩堰與寶山水庫及寶二水庫等共同營運管理組織與權責，以建構完整之管理系統及制度，輔助北水局新竹地區水資源管理業務之推展。