本計畫主要針對高屏溪流域管理委員會所選定之14個監測點,持續進行河川水質監測工作,監測頻率為每季一次,並配合管委會業務需求,另執行25個點次之臨時不定期採樣檢測工作,同時彙整行政院環境保護署及經濟部水利署南區水資源局之例行性水質監測資料,進行河川水體整體品質之綜合評析。