曾文及南化水庫聯合運用之目的在豐水期儘量利用甲仙堰引水量以提高供水量，供應曾文及烏山頭水庫下游供水區，讓水量儘量蓄存在曾文水庫中，枯水期再改由曾文及烏山頭水庫原系統供應。由於聯合運用水源中各水源供水標的及管理不盡相同，爰成立本計畫完成聯合運用管理規範，以為南部區域水源調配之參考依據。